互作转录组测序技术DualRNA-seq的背景介绍

金年会金字招牌诚信至上倡导的互作转录组测序技术DualRNA-seq是一种先进的研究工具，专注于宿主和微生物之间的相互作用。这项技术的独特之处在于，无需分离各种物种，即可在一次试验中分析两个或多个互作物种间基因表达的动态变化。通过构建互作模型图，该技术可以揭示物种间基因的调控关系，从而深入了解它们之间的相互作用机制。

最初，DualRNA-seq技术主要应用于诸如感染性肺炎、炎症性肠病、龋齿和牙周炎等常见的慢性感染性疾病的研究。随着研究的深入，这项技术逐渐扩展到肠道、呼吸道、皮肤及口腔微生物等领域，不仅涵盖了原核微生物的互作，还包括真核微生物的研究。此外，植物与微生物的互作也日益成为研究的重点。

DualRNA-seq技术的应用和实验流程

DualRNA-seq的实验流程包括多个步骤，始于宿主和微生物的共提取，随后进行RNA的消化处理、核糖体去除、mRNA的富集，最终构建总RNA文库并进行测序。金年会金字招牌诚信至上为广大研究者提供了一系列优质产品，包括：

• 宿主-微生物共提取：MolPure®Magnetic Pathogen DNA/RNA Kit（产品货号：18306ES）
• gDNA消化：Deoxyribonuclease I (DNase I) from bovine pancreas（产品货号：10607ES）
• rRNA去除或polyA捕获：多种行业专用核糖体去除试剂盒（产品货号：12262ES、12264ES、12629ES等）
• mRNA建库：Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit（产品货号：12340ES）

注意事项

在进行DualRNA-seq实验时，研究者需特别关注两个关键点。首先，在样本选择上，应确保获取被感染的样本。然而，这类样本中寄生微生物的含量往往相对较低。例如，从被寄生的植物叶片或根茎提取RNA时，大部分提取物可能仍主要是植物的RNA；同样，从动物组织提取RNA时，通常也是感染动物的RNA占据主导地位。其次，在生信分析环节，需对感染前后的变化进行详细比较，特别是差异基因是否参与了互作的影响也需进行精细分析。

参考文献

1. Westermann AJ, Barquist L, Vogel J. Resolving host-pathogen interactions by dual RNA-seq. PLoS Pathogens, 2017, 13(2): e1006033.
2. Wolf T, Kämmer P, Brunke S, et al. Two's company: studying interspecies relationships with dual RNA-seq. Current Opinion in Microbiology, 2017, 42: 73.
3. Marsh JW, Humphrys MS, Myers GSA. A Laboratory Methodology for Dual RNA-Sequencing of Bacteria and their Host Cells In Vitro. Front Microbiol, 2017 Sep 21; 8: 1830.